WP1: Metodolog\u00eda, protocolo y desarrollo de una base de datos de tumores cerebrales usando HSI.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\nEste paquete de trabajo tiene el objetivo principal de generar la base de datos de im\u00e1genes hiperespectrales de tejido cerebral a partir de muestras in-vivo, ex-vivo e in-vitro. Se dispondr\u00e1 de una serie de operaciones neuroquir\u00fargicas adecuadas para la captura de im\u00e1genes cerebrales hiperespectrales in-vivo y ex-vivo usando el sistema de adquisici\u00f3n hiperespectral disponible.<\/p>\n
![\"\"](\"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/wp-content\/uploads\/2018\/10\/sensors-18-02314-g001-300x137.jpg\")
Adem\u00e1s, se establecer\u00e1 un protocolo de seguridad para resecar las muestras de los tejidos in-vivo y el procedimiento para asociar estas muestras con el an\u00e1lisis patol\u00f3gico. Por \u00faltimo, un an\u00e1lisis completo de las im\u00e1genes capturadas por el demostrador ser\u00e1 realizado por el neurocirujano a cargo de la operaci\u00f3n actual con el fin de proporcionar informaci\u00f3n precisa para el etiquetado de la imagen capturada como referencia. Por otra parte, se preparar\u00e1n las muestras in-vitro de tejido cerebral, adquiridas en esas operaciones, con y sin tinci\u00f3n. El an\u00e1lisis histol\u00f3gico se llevar\u00e1 a cabo con el fin de proporcionar el resultado del diagn\u00f3stico del tejido capturado seg\u00fan los criterios de la OMS. Las muestras in-vitro ser\u00e1n capturadas con el sistema hiperespectral microsc\u00f3pico para obtener los cubos hiperespectrales. Estos resultados se utilizar\u00e1n como referencia en el proceso de etiquetado de los cubos in-vivo, ex-vivo e in-vitro capturados.<\/p>\n
![\"\"](\"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/wp-content\/uploads\/2018\/10\/Imagen2-300x51.png\")
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WP2: Desarrollo de algoritmos de diferenciaci\u00f3n\/clasificaci\u00f3n de tumores cerebrales.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\nEl objetivo de este paquete de trabajo es desarrollar un conjunto de algoritmos de clasificaci\u00f3n de im\u00e1genes cerebrales con el fin de distinguir entre tejido tumoral y tejido cerebral normal, as\u00ed como determinar el diagn\u00f3stico exacto de los tejidos tumorales seg\u00fan la clasificaci\u00f3n de la OMS. ![\"\"](\"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/wp-content\/uploads\/2018\/10\/sensors-18-00430-g001-300x182.jpg\")
Los algoritmos ser\u00e1n verificados en este WP utilizando la base de datos de im\u00e1genes hiperespectrales generadas en el WP1. Se desarrollar\u00e1n de forma independiente algoritmos de procesado para los distintos tipos de im\u00e1genes capturadas.<\/p>\n
Se estudiar\u00e1 la validez de los resultados obtenidos al utilizar los mismos algoritmos para los distintos tipos de im\u00e1genes hiperespectrales disponibles (in-vivo, ex-vivo e in-vitro) y se analizar\u00e1 la correlaci\u00f3n entre la respuesta espectral de las diferentes muestras.<\/p>\n
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WP3: Aceleraci\u00f3n de los algoritmos de clasificaci\u00f3n de tumores cerebrales.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\nEl objetivo principal de este paquete de trabajo es implementar y acelerar los algoritmos de clasificaci\u00f3n de tumores cerebrales desarrollados en el WP2 en una plataforma de aceleraci\u00f3n hardware<\/em>. Proporcionar los resultados de los algoritmos en tiempo real, facilitar\u00e1 la toma de decisiones del neurocirujano a la hora de resecar el tumor durante las operaciones neuroquir\u00fargicas. Para cumplir los requisitos de tiempo real, se realizar\u00e1 un an\u00e1lisis detallado de la paralelizaci\u00f3n de los algoritmos desarrollados en el que se identifiquen los cuellos de botella que ser\u00e1n ejecutados en un acelerador hardware<\/em> para alcanzar el rendimiento m\u00e1ximo. Se habr\u00e1 de seleccionar la plataforma de c\u00f3mputo m\u00e1s adecuada para esta aplicaci\u00f3n, donde se evaluar\u00e1n FPGAs, GPUs, MPPAs o sistemas heterog\u00e9neos. Finalmente, se llevar\u00e1 a cabo la verificaci\u00f3n funcional del sistema implementado.<\/p>\n![\"\"](\"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/wp-content\/uploads\/2018\/10\/Captura-300x50.jpg\")
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WP4: Demostrador y validaci\u00f3n final.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\nEl objetivo principal de este paquete de trabajo es realizar la integraci\u00f3n completa del demostrador y realizar una validaci\u00f3n de los resultados del sistema hiperespectral durante las operaciones neuroquir\u00fargicas con el fin de validar los resultados proporcionados por los algoritmos. La validaci\u00f3n del sistema requerir\u00e1 la intervenci\u00f3n conjunta de todo el equipo de investigaci\u00f3n del proyecto (neurocirujanos, pat\u00f3logos e ingenieros). Se establecer\u00e1 un protocolo para analizar los resultados proporcionados por el sistema y validar sus resultados. Esta validaci\u00f3n contemplara tanto la calidad de los resultados como su obtenci\u00f3n en tiempo real.<\/p>\n
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WP5: Diseminaci\u00f3n de resultados.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\nEl objetivo principal de este paquete de trabajo es el de difundir los resultados del proyecto. Estos resultados ser\u00e1n presentados a la comunidad cient\u00edfica que trabaja en el \u00e1mbito del procesamiento de im\u00e1genes aplicadas al \u00e1rea de la bioingenier\u00eda, as\u00ed como a los expertos en el campo de la oncolog\u00eda neurol\u00f3gica. Trasversalmente, se difundir\u00e1n los resultados acerca de metodolog\u00edas de implementaci\u00f3n de algoritmos de procesado de im\u00e1genes hiperespectrales.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
El proyecto se organiza en cinco paquetes de trabajo, cuatro dedicados al trabajo cient\u00edfico y uno dedicado a la difusi\u00f3n de los resultados. WP1: Metodolog\u00eda, protocolo y desarrollo de una base de datos de tumores cerebrales usando HSI. Este paquete de trabajo tiene el objetivo principal de generar la base de datos de im\u00e1genes […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-77","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/77","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=77"}],"version-history":[{"count":10,"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/77\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":240,"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/77\/revisions\/240"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=77"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}
Adem\u00e1s, se establecer\u00e1 un protocolo de seguridad para resecar las muestras de los tejidos in-vivo y el procedimiento para asociar estas muestras con el an\u00e1lisis patol\u00f3gico. Por \u00faltimo, un an\u00e1lisis completo de las im\u00e1genes capturadas por el demostrador ser\u00e1 realizado por el neurocirujano a cargo de la operaci\u00f3n actual con el fin de proporcionar informaci\u00f3n precisa para el etiquetado de la imagen capturada como referencia. Por otra parte, se preparar\u00e1n las muestras in-vitro de tejido cerebral, adquiridas en esas operaciones, con y sin tinci\u00f3n. El an\u00e1lisis histol\u00f3gico se llevar\u00e1 a cabo con el fin de proporcionar el resultado del diagn\u00f3stico del tejido capturado seg\u00fan los criterios de la OMS. Las muestras in-vitro ser\u00e1n capturadas con el sistema hiperespectral microsc\u00f3pico para obtener los cubos hiperespectrales. Estos resultados se utilizar\u00e1n como referencia en el proceso de etiquetado de los cubos in-vivo, ex-vivo e in-vitro capturados.<\/p>\n<\/p>\nWP2: Desarrollo de algoritmos de diferenciaci\u00f3n\/clasificaci\u00f3n de tumores cerebrales.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\nEl objetivo de este paquete de trabajo es desarrollar un conjunto de algoritmos de clasificaci\u00f3n de im\u00e1genes cerebrales con el fin de distinguir entre tejido tumoral y tejido cerebral normal, as\u00ed como determinar el diagn\u00f3stico exacto de los tejidos tumorales seg\u00fan la clasificaci\u00f3n de la OMS. Los algoritmos ser\u00e1n verificados en este WP utilizando la base de datos de im\u00e1genes hiperespectrales generadas en el WP1. Se desarrollar\u00e1n de forma independiente algoritmos de procesado para los distintos tipos de im\u00e1genes capturadas.<\/p>\n
Se estudiar\u00e1 la validez de los resultados obtenidos al utilizar los mismos algoritmos para los distintos tipos de im\u00e1genes hiperespectrales disponibles (in-vivo, ex-vivo e in-vitro) y se analizar\u00e1 la correlaci\u00f3n entre la respuesta espectral de las diferentes muestras.<\/p>\n
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WP3: Aceleraci\u00f3n de los algoritmos de clasificaci\u00f3n de tumores cerebrales.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\nEl objetivo principal de este paquete de trabajo es implementar y acelerar los algoritmos de clasificaci\u00f3n de tumores cerebrales desarrollados en el WP2 en una plataforma de aceleraci\u00f3n hardware<\/em>. Proporcionar los resultados de los algoritmos en tiempo real, facilitar\u00e1 la toma de decisiones del neurocirujano a la hora de resecar el tumor durante las operaciones neuroquir\u00fargicas. Para cumplir los requisitos de tiempo real, se realizar\u00e1 un an\u00e1lisis detallado de la paralelizaci\u00f3n de los algoritmos desarrollados en el que se identifiquen los cuellos de botella que ser\u00e1n ejecutados en un acelerador hardware<\/em> para alcanzar el rendimiento m\u00e1ximo. Se habr\u00e1 de seleccionar la plataforma de c\u00f3mputo m\u00e1s adecuada para esta aplicaci\u00f3n, donde se evaluar\u00e1n FPGAs, GPUs, MPPAs o sistemas heterog\u00e9neos. Finalmente, se llevar\u00e1 a cabo la verificaci\u00f3n funcional del sistema implementado.<\/p>\n<\/p>\n
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WP4: Demostrador y validaci\u00f3n final.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\nEl objetivo principal de este paquete de trabajo es realizar la integraci\u00f3n completa del demostrador y realizar una validaci\u00f3n de los resultados del sistema hiperespectral durante las operaciones neuroquir\u00fargicas con el fin de validar los resultados proporcionados por los algoritmos. La validaci\u00f3n del sistema requerir\u00e1 la intervenci\u00f3n conjunta de todo el equipo de investigaci\u00f3n del proyecto (neurocirujanos, pat\u00f3logos e ingenieros). Se establecer\u00e1 un protocolo para analizar los resultados proporcionados por el sistema y validar sus resultados. Esta validaci\u00f3n contemplara tanto la calidad de los resultados como su obtenci\u00f3n en tiempo real.<\/p>\n
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WP5: Diseminaci\u00f3n de resultados.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\nEl objetivo principal de este paquete de trabajo es el de difundir los resultados del proyecto. Estos resultados ser\u00e1n presentados a la comunidad cient\u00edfica que trabaja en el \u00e1mbito del procesamiento de im\u00e1genes aplicadas al \u00e1rea de la bioingenier\u00eda, as\u00ed como a los expertos en el campo de la oncolog\u00eda neurol\u00f3gica. Trasversalmente, se difundir\u00e1n los resultados acerca de metodolog\u00edas de implementaci\u00f3n de algoritmos de procesado de im\u00e1genes hiperespectrales.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
El proyecto se organiza en cinco paquetes de trabajo, cuatro dedicados al trabajo cient\u00edfico y uno dedicado a la difusi\u00f3n de los resultados. WP1: Metodolog\u00eda, protocolo y desarrollo de una base de datos de tumores cerebrales usando HSI. Este paquete de trabajo tiene el objetivo principal de generar la base de datos de im\u00e1genes […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":{"footnotes":""},"class_list":["post-77","page","type-page","status-publish","hentry"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/77","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=77"}],"version-history":[{"count":10,"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/77\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":240,"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/pages\/77\/revisions\/240"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/ithaca.iuma.ulpgc.es\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=77"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}
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WP4: Demostrador y validaci\u00f3n final.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\nEl objetivo principal de este paquete de trabajo es realizar la integraci\u00f3n completa del demostrador y realizar una validaci\u00f3n de los resultados del sistema hiperespectral durante las operaciones neuroquir\u00fargicas con el fin de validar los resultados proporcionados por los algoritmos. La validaci\u00f3n del sistema requerir\u00e1 la intervenci\u00f3n conjunta de todo el equipo de investigaci\u00f3n del proyecto (neurocirujanos, pat\u00f3logos e ingenieros). Se establecer\u00e1 un protocolo para analizar los resultados proporcionados por el sistema y validar sus resultados. Esta validaci\u00f3n contemplara tanto la calidad de los resultados como su obtenci\u00f3n en tiempo real.<\/p>\n
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WP5: Diseminaci\u00f3n de resultados.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\nEl objetivo principal de este paquete de trabajo es el de difundir los resultados del proyecto. Estos resultados ser\u00e1n presentados a la comunidad cient\u00edfica que trabaja en el \u00e1mbito del procesamiento de im\u00e1genes aplicadas al \u00e1rea de la bioingenier\u00eda, as\u00ed como a los expertos en el campo de la oncolog\u00eda neurol\u00f3gica. Trasversalmente, se difundir\u00e1n los resultados acerca de metodolog\u00edas de implementaci\u00f3n de algoritmos de procesado de im\u00e1genes hiperespectrales.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
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WP5: Diseminaci\u00f3n de resultados.<\/strong><\/span><\/h4>\n<\/li>\n<\/ul>\n
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